Algues modèles

Solieria chordalis

L'algue rouge Solieria chordalis (J. Agardh) C. Agardh appartient à l'ordre des Gigartinales, famille des Solieriacées. Elle se répartit du Maroc jusqu'au sud de l'Angleterre et, sur les côtes françaises, elle a été recensée depuis les côtes vendéennes (île de Ré) jusqu'au Cotentin en passant par le Golfe du Morbihan et la rade de Brest.
Solieria chordalis se présente sous la forme d'un thalle rouge-rose, cylindrique et ferme, pouvant atteindre 15-20 cm de haut et 0,5-2 mm de diamètre. Le thalle se développe à partir d'une base fibreuse constituée de filaments enchevêtrés, les haptères, qui forment des crampons entourant le point d'ancrage de l'algue. Les axes principaux sont ramifiés de façon irrégulière et se couvrent en période de croissance de petites protubérances qui se développent en ramules. Ces ramules peuvent se détacher et se fixer au substrat pour donner un nouvel individu. Ce mode de reproduction semble être prédominant pour la population de Solieria chordalis de la rade de Brest. Le cycle de reproduction est trigénétique, haplodiplophasique et isomorphe.
Solieria chordalis est une algue pérennante vivant dans des stations de faible profondeur (0 à -5 m par rapport au niveau de la basse mer) sur une grande variété de substrats, allant des faciès vaseux aux graviers, débris de coquillage et même aux algues calcaires constituant le maerl. Son implantation se fait dans des zones plus ou moins abritées, parfois turbides où les variations du milieu peuvent être relativement importantes.
Solieria chordalis est exploitée au LÉBHAM comme algue modèle tant au niveau de l'étude des carraghénanes que de l'étude de son adaptation métabolique à différentes conditions de l'environnement lors de cultures en conditions contrôlées.

Turbinaria ornata

Turbinaria ornata (Turner) J. Agardh est une algue brune appartenant à l'ordre des Fucales et à la famille des Sargassaceae. Il s'agit d'un genre exclusivement tropical : il est signalé dans le Nord-Est de l'Australie, en Mer Rouge, Inde, Indonésie, Japon, Antilles ... L'espèce T. ornata est très largement distribuée dans la flore des régions tropicales et subtropicales. En Polynésie française, seule cette espèce a été signalée.
Les Turbinaires sont caractérisées par une structure cladomienne décrite chez les thallophytes les plus évolués. T. ornata présente un axe principal coriace de couleur marron à marron clair portant des ramifications latérales ou pleuridies de petite taille dont la disposition générale donne à l'algue un volume cylindrique.
Cette espèce est caractérisée par un cycle de reproduction monogénétique diploïde avec la présence toute l'année d'un sporophyte sur le récif.
En Polynésie française, T. ornata partage l'espace intertidal et subtidal avec différents genres d'algues brunes. Elle est présente jusque sur la pente externe du récif jusqu'à une profondeur de 10 mètres. C'est une espèce dominante sur l'ensemble du récif (PAYRI, 1982) et est largement répartie sur les substrats morts (colonies coralliennes, roches ...). Cette algue forme aussi des radeaux flottant caractéristiques autour des îles hautes de Polynésie française. Cette espèce est considérée dans ces îles du Pacifique comme une algue proliférante depuis quelques années car on observe une augmentation de sa biomasse.
Cette algue est utilisée dans le cadre d'une collaboration avec l'Université Française du Pacifique (Laboratoire d'Ecologie Marine, Professeur C. PAYRI) au niveau de l'étude de substances à activité biologiques en particulier dans les domaines médicaux et paramédicaux (cosmétologie par exemple). Ce projet de valorisation conduit à un partenariat avec un industriel local (bourse CIFRE, Société CAIRAP).

Sargassum mangarevense

Sargassum mangarevense (Grunow) Setchell est une algue brune appartenant à l'ordre des Fucales et à la famille des Sargassaceae. Environ 400 espèces très polymorphes du genre Sargassum sont répertoriées dans le monde. En Polynésie 9 espèces ont été décrites. Le genre Sargassum est très largement distribué dans les eaux chaudes et tempérées, spécialement dans les régions de l'Indo-Pacifique et de l'Australie. Ce genre retient l'attention depuis de nombreuses années du fait de l'extension géographique de Sargassum muticum sur les côtes pacifiques de l'Amérique du Nord et atlantiques de l'Europe.
S. mangarevense présente un thalle de couleur jaune-brun clair constitué de deux parties : une partie pérennante constituée d'un disque de fixation permettant à l'algue de s'accrocher au substrat et d'un axe principal ou stipe à croissance très lente ; une partie annuelle formée de ramifications latérales se développant sur l'axe principal et constituées soit d'expansions foliacées ou frondes, soit de frondes et de vésicules aérifères ou flotteurs, soit de frondes, de vésicules et des organes reproducteurs. La taille maximale d'un thalle entier peut atteindre 48 cm.
Cette espèce est caractérisée par un cycle de reproduction monogénétique diploïde avec également la présence toute l'année d'un sporophyte sur le récif.
S. mangarevense se localise préférentiellement dans la zone externe du récif, sur la crête, où elle forme une véritable ceinture algale dans une zone à fort hydrodynamisme et régulièrement exondé à marée basse. Dans le lagon, elle colonise la partie affleurante des pâtés coralliens du récif barrière. Cette espèce est également considérée, en Polynésie française, comme une algue proliférante depuis quelques années car on observe une augmentation de sa biomasse.
Tout comme Turbinaria ornata, cette espèce fait l'objet d'études de valorisation en partenariat avec l'Université Française du Pacifique.

Cyanobactéries marines d'origine tropicale "Kopara"

Les tapis microbiens sont des structures généralement stratifiées et formées de plusieurs couches de couleurs différentes. Ces successions très caractéristiques sont rencontrées dans des lagunes salées ou hypersalées des zones tempérées à tropicales. Ils résultent du développement de microorganismes, regroupant cyanobactéries et bactéries phototrophes anoxygéniques répartis verticalement selon un triple gradient de lumière, d'oxygène et de sulfures. Les bactéries possèdent des pigments particuliers leur permettant de se développer en profondeur et ce, dans des environnements anoxiques souvent riches en sulfure. Elles ont un rôle écologique important pour recycler, grâce à leur photosynthèse, certains composés organiques et pour limiter la diffusion du sulfure toxique dans les environnements où il est produit. De plus, bactéries et cyanobactéries sont recherchées dans les applications biotechnologiques pour leur rôle sulfooxydant et/ou pour leur production de caroténoïdes particuliers utilisés comme colorants alimentaires.
En Polynésie française, sur les couronnes coralliennes des atolls et dans les motu de certaines îles hautes de la Société, se développent des tapis microbiens dont l'épaisseur varie selon les lieux et les conditions environnementales de quelques millimètres à plusieurs dizaines de centimètres. Dans l'archipel des Tuamotu ces mattes microbiennes de couleur rougeâtres et d'aspect gélatineux sont dénommés " Kopara ". Cette ressource naturelle était consommée en période de disette et semble encore introduite dans l'alimentation dans certains archipels du Pacifique central et Nord-Ouest. Elle pouvait servir également comme emplâtre cicatrisant. Certaines propriétés du Kopara sont susceptibles de lui conférer un intérêt dans divers domaines d'application comme les domaines nutritionnel, médical et paramédical (propriétés antibactériennes et cicatrisantes), alimentaire (caroténoïdes en temps que colorant) et pédologique (stabilisateurs).
La structure générale du Kopara est assez homogène, quel que soit le type de mare. Le Kopara est un tapis microbien laminé verticalement. Il est dominé, comme la majorité des tapis microbiens, par quelques groupes fonctionnels de microrganismes : les cyanobactéries (celles du genre Phormidium accompagné par les Scytonema, les Schizothrix et les Chlorococcales), les bactéries photosynthétiques sulfureuses (celles de type Chromatium et Thiocapsa par exemple), les bactéries rouges non sulfureuses (PNSB dont les Rhodospirillum et les Rhodopseudomonas/Rhodobium/Blastochloris) et les sulfatoréducteurs (en majorité des Desulfovibrio). La majorité des mares est caractérisée par l'absence de tout organisme vivant. On peut noter toutefois la présence de poissons du genre Tilapia se nourrissant à l'occasion de la microcouche supérieure des cyanobactéries. Cette absence pourrait être liée à la présence de très fortes concentrations en sulfures libres, concentrations pouvant être expliquées par l'absence ou les faibles teneurs en fer des tapis ce qui rend le piégeage des sulfures faible voire impossible.

Halophytes modèles

Suaeda maritima Dum.

Suaeda maritima Dum. est une dicotylédone de la famille des Chénopodiacées. La description choisie est celle de la flore et de la végétation du massif Armoricain (Des Abbayes et al., 1971).

- Description de Suaeda maritima Dum. : Herbe annuelle, dressée ou diffuse, 10-50 cm, glabre. Feuilles rapprochées, 8-10 mm, vert glauque ou rougeâtres, demi-cylindriques, plates dessus, aiguës. Graines verticales de 2 sortes : les premières formées noir luisant, presque lisses, larges de 1-2,5mm ; les dernières brun clair ou olive, mates, réticulées, larges de 2 mm. Floraison de juillet à septembre. - Slikkes et flaques des shorres. Très commune sur toute la côte.

Atriplex portulacoides

Atriplex portulacoides est une dicotylédone de la famille des Chénopodiacées.La description choisie est celle de la flore de la végétation du massif Armoricain (Des Abbayes et al., 1971). A.portulacoides y est classé dans le genre Obione décrit comme possédant les mêmes caractères généraux que le genre Atriplex.

- Description de l'espèce Obione portulacoides Moq. (Atriplex portulacoides L.). - Sous-arbrisseau de 20-50 cm, blanchâtre-argenté, à tiges couchées, radicantes et rameaux redressés, formant des touffes compactes. Feuilles inférieures opposées, obovales ou oblongues, uninervées, obtuses, entières, atténuées en court pétiole, épaisses-charnues, 3-5 cm. Bractéoles fructifères subsessiles, en triangle renversé, avec au sommet 3 lobes dont le médian souvent plus petit, à faces muriquées. Graine rousse. Floraison de juillet à septembre. Chamaephyte ligneuse (plante vivace ayant ses bourgeons à moins de 25 cm au-dessus du sol). - Vase des schorres où il peut faire des peuplements denses, surtout à la base des schorres ou au bord des marigots ; rochers maritimes, bord des marais salants. - Très commun sur toute la côte.

Selon la nouvelle flore des îles Britanniques (New Flora of the British Isles de Stace, 1991) Obione portulacoides Moq. est actuellement classée dans le genre Atriplex portulacoides. Sa nomenclature actuelle est Atriplex portulacoides L..

Des Abbayes H., Claustres G. Corillion R. et Dupont P., 1971. Flore et Végétation du Massif Armoricain. Tome 1 - Flore vasculaire. Edition Presse Universitaire de Bretagne, Saint Brieuc, 1226 pp.

Stace C., 1991. New flora of the British Isles. B.S.E. St Edmundsbury Press Ltd., Sulfolk Ed., Cambridge University Press, Cambridge, 1226 pp.