Université de Bretagne Occidentale (UBO)

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FORMATION INITIALE

2016 : Habilitation à Diriger des Recherches HDR, Université de Bretagne Occidentale
2007 : Doctorat en cotutelle, en Halieutique de l’Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, France et Ph.D. en Océanographie de l’Université du Connecticut, USA.
2007 : Master en Océanographie de l’Université du Connecticut, USA.
2003 : Diplôme d’agronomie approfondie (DAA) d’agronomie, de l’Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, spécialisation Halieutique.

EXPERIENCE PROFESSIONNELLE

Depuis 2021 : Directrice de Recherche (DR2) CNRS au Laboratoire des Sciences et de l’Environnement Marin LEMAR, Plouzané, France.
Depuis 2013 : Chargé de Recherche (CR1) CNRS au Laboratoire des Sciences et de l’Environnement Marin LEMAR, Plouzané, France.
2009-2013 : Chargé de Recherche (CR2) CNRS au Laboratoire des Sciences et de l’Environnement Marin LEMAR, Plouzané, France
2009 : Cadre de recherche au laboratoire Phycotoxines à Ifremer, Nantes, France
2009 : Contrat postdoctoral au Laboratoire des Sciences et de l’Environnement Marin LEMAR, Plouzané, France Projet « Rédaction d’un projet ANR sur l’impact des efflorescences de diatomées toxiques Pseudo-nitzschia sur l’accumulation de toxines amnésiantes chez les coquilles Saint-Jacques »
2008 : Contrat postdoctoral à l’ Universidad de Los Lagos (Centro I-MAR), Puerto Montt, Chili Projet « Etude l’impact des efflorescences de dinoflagellés toxiques Alexandrium catenella sur la réponse physiologique des pétoncles»
2007 : Attaché Temporaire d’Enseignement et de Recherche (ATER) à l’IUT de Brest, Université de Bretagne Occidentale, France
2004-2007 : Contrat doctoral à l’Université du Connecticut, USA. Projet « Impact des efflorescences de phytoplancton toxique sur les réponses immunitaires des bivalves»

PARTICIPATION ET RESPONSABILITES DE PROJETS

Internationaux :

2016-2020 : Responsable scientifique pour le CNRS d’un projet H2020 RISE PADDLE « Planning in A liquiD worlD with tropicaL StakEs: solutions from an EU-Africa-Brazil perspective” porté par M. Bonnin (IRD), LEMAR, Brest
2017-2020: Participation à un projet Européen INTERREG VB NWE intitulé ALG-AD : Creating value from waste nutrients by integrating algal and anaerobic digestion technology
2017-2020: Participation à un projet de recherche canadien NSERC intitule “Behavioural and physiological responses of cultured bivalves to harmful algal blooms: early warning system and risk assessment », porté par R. Tremblay, UQAR, Canada
2014-2017 : Participation à un projet de recherche brésilien CNPq, sur l’utilisation de microalgues du Nordeste pour l’élaboration de biodiesel en collaboration avec R. Sassi, Université Fédérale de Paraiba, Brésil.
2013-2016 : Responsabilité (PI) d’un programme d’échange CNRS PICS (Programme International de Coopération Scientifique) entre la France et le Brésil (15k€) sur l’impact des facteurs biotiques (HAB et pathogènes) sur la physiologie des bivalves.
2012-2014 : Participation à un projet de recherche chilien FONDECYT sur l’étude transcriptomique de la réponse immunitaire de bivalves exposés à Alexandrium catenella: en collaboration avec l’Université de Concepcion, Chili
2012-2014 : Participation à un projet européen intitulé “MICRO : MicroPlastics- Is it a threat for the 2 Seas Area?” par l’Interreg IV-A 2 Mers
2011-2012 : Responsabilité (PI) d’un programme d’échange de chercheurs CNRS-CNPq, France-Brésil (6k€) sur la perkinsiose chez les bivalves.
2008 : Responsabilité d’un projet Lavoisier (EGIDE) du « Ministère des Affaires Etrangères et Européennes » pour un séjour de recherche à l’Universidad de Los Lagos au Chili (2008; 12k€).

Nationaux

2019-2024: Responsable scientifique pour le LEMAR et Responsable de la tache 2 d’un projet France Filière Pêche, MASCOET : Maintien du Stock de Coquillages en lien avec la problématique des Efflorescences Toxiques, PI A. Blanchet et P. Cugier, IFREMER (999 kE)
2019-2021 : Participation à un projet Ec2Co Ecodyn « HERITAGe: HERitabilité, épITranscriptome et Adaptation chez l’huître C. Gigas Effets de contaminants émergents, microplastiques et microalgues toxiques, sur le développement de l'huître via héritabilité épigénétique par méthylation de l'ARN », PI G. Rivière, BOREA, Caen (13kE)
2019-2021 : Participation à un projet Ec2Co Microbien ‘Let It Be : Microalgues ichtyotoxiques du littoral français : quels Liens Entre ToxicITé BIologique,chimiodiversité et diversité génétique au sein du genre Karlodinium ? », PI M. Lassudrie, Ifremer LER/BO, Concarneau (15kE)
2017-2018: Responsable scientifique d’un projet Boost’partenariat de la Région Bretagne pour le montage d’un projet H2020 ITN/ETN sur les « fish killing toxins ou ichtyotoxines », dépôt effectué le 15 janvier 2019.
2016-2020 : Participation à un projet de recherche ANR «Nanoplastics» porté par Fabienne Lagarde, France : « Microplastics, nanoplastics in the environment: difference of scale, difference of behavior?».
2016-2020 : Participation à un projet de recherche ANR ACHN «PARASED» porté par Aurélie Chambouvet, LEMAR, France : « Ecologie fonctionnelle des protistes parasites dans le compartiment benthique ».
2014-2017 renouvelé pour 2018-2022: Responsable (PI) d’un Groupement de Recherche national GdR3659 CNRS/IFREMER (en collaboration avec P. Hess) intitulé « PHYCOTOX : Des microalgues aux risques pour l’Homme et l’écosystème » (30-40 k€/an, 140 personnes)
2015 - 2017 : Participation au projet de recherche ALGUENCHAINE : nouvelle voie de traitement du lisier par bio-remédiation via la production de microalgues, en partenariat avec l’entreprise NUTREA ; financement Région Bretagne.
2013-2017 : Co-coordination avec C. Fabioux (co-coordinatrice) et P. Soudant (Project Leader) d’une ANR CESA « ACCUTOX : De la caractérisation des déterminants de l’accumulation des toxines paralysantes (PST) chez l’huître (C. gigas) au risque sanitaire dans son contexte sociétal » (440k€)
2013-2016 : Coordination pour le LEMAR d’un projet de science participative PHENOMER de la Fondation de France, porté par Amélia Curd (Dyneco, Ifremer) (120k€)
2013 : Responsable (PI) d’un projet de recherche Europole Mer sur l’impact des facteurs biotiques (HAB et pathogènes) sur les populations d’huitres de mangroves Crassostrea gasar, en collaboration avec l’Université Fédérale de Paraiba
2011-2013 : Participation à un projet EC2CO Cytrix et PNEC Perturbations des rythmes biologiques de l’huître Crassostrea gigas par les efflorescences d’algues toxiques. Approches écotoxicologiques et éthologiques.
2010-2011 : Responsabilité (PI) d’un programme de recherche de la Région Bretagne SAD – « PSEUDOPE » Interactions de Pseudo-nitzschia spp. avec les procaryotes et eucaryotes unicellulaires sympatriques (32k€)
2009-2010 : Participation à un projet Ec2Co Microbien intitulé « Interactions de Pseudo-nitzschia spp. avec les procaryotes et eucaryotes unicellulaires sympatriques », porté par P. Soudant, LEMAR
2009-2012 : Participation à un projet LITEAU3 REPAMEP Réponse des palourdes aux stress environnementaux combinant métaux, efflorescences toxiques et pathogènes, porté par X. de Montaudouin, EPOC, Bordeaux
2009 - 2012 : Participation à un programme MEEDDAT Pesticides, TOPHYPAC, Tolérance des communautés phytoplanctoniques aux phytosanitaires dans le Panache de la Charente porté par S. Stashowski IFREMER Nantes.
2010 - 2013 : Participation à un projet ANR JCJC intitulé ICOP « Impact des interactions Fe-Cu sur le phytoplancton océanique » porte par E. Bucciarelli LEMAR.

 RESPONSABILITES ACADEMIQUES PRIX ET VALORISATION SCIENTIFIQUE

 Encadrement:

-Encadrement scientifique de dix thèses :
Neuf en France, l’Université de Bretagne Occidentale et à l’Université de Bretagne Loire, dont 5 soutenues :
2009-2012: Aurélie Lelong. Sujet: « Interactions entre Pseudo-nitzschia spp. et procaryotes et eucaryotes sympatriques», Université de Bretagne Occidentale (dir. thèse : Dr. Philippe Soudant, resp. scientifique: H. Hégaret)
Aurélie est actuellement MCF en CDI à MEDISUP à Paris (depuis 2013)
2011-2014: Malwenn Lassudrie Sujet: «Effet combinés de l’impact d’Alexandrium sp. et de pathogènes sur les réponses physiologiques de deux espèces de bivalves», Université de Bretagne Occidentale (dir. thèse : Dr. Philippe Soudant, resp. scientifiques : H. Hégaret, C. Fabioux)
Malwenn est actuellement cadre de de recherche à l’IFREMER de Concarneau
2013-2017: Floriane Boullot Sujet: «Implication des canaux sodium voltage-dépendant dans la réponse aux toxines chez l’huître creuse Crassostrea gigas : le cas des PST», Université de Bretagne Occidentale (dir. thèse : Dr. Pierre Boudry et Philippe Soudant, resp. scientifiques : H. Hégaret, C. Fabioux)
Floriane est actuellement ATER à l’Université de Rennes
2015-2018: Justine Castrec Sujet: «Impact des efflorescences de dinoflagellés toxiques sur la reproduction d’huîtres d’intérêt économique en Rade de Brest », Université de Bretagne Occidentale (Dir. thèse : Dr. P. Soudant, resp. scientifiques : C. Fabioux, H. Hégaret)
Justine est en contrat de ATER recherche au LEMAR depuis janvier 2019
2015-2018: Marc Long Sujet: «Allélopathie chez Alexandrium sp.» thèse en cotutelle entre l’Université de Bretagne Occidentale et l’Université de Wollongong en Australie (Dir. thèse : Dr. H. Hégaret et Dr. D. Jolley, resp. scientifiques : G. Sarthou, P. Soudant)
Marc est en contrat post-doctoral à Ifremer-Dyneco depuis mars 2019

Et quatre en cours cours
2017-2020: Sylvain Gaillard Sujet: «Influence des facteurs clés du changement global sur la physiologie de Dinophysis sp.: toxicité et impact sur la reproduction des bivalves» thèse à l’Université de Bretagne Loire (Dir. thèse : Dr. P. Hess, H. Hégaret, resp. scientifiques : V. Séchet, D. Reveillon)2019-2022: Jose Corona Sujet: «Mécanismes physiologiques associés à la contamination des Pectinidés en acide domoïque» Université de Bretagne Occidentale (Dir. thèse : Dr. H. Hégaret, C. Fabioux, resp. scientifiques : M. Lassudrie, E. Fleury)
2019-2022: Lou Mary Sujet: «Cartographie génétique des phénotypes moléculaires par une approche multi-omique chez le dinoflagellé toxique Alexandrium minutum» Université de Bretagne Occidentale (Dir. thèse : Dr. H. Hégaret, resp. scientifiques : M. Le Gac, D. Réveillon, S. Artigaud, Y. Even)
2020-2023: Margot Deleglise Sujet: «Etude des cinétique de contamination et décontamination des Pectinidés en acide domoïque lors d’efflorescences toxiques de Pseudonitzschia» Université de Bretagne Occidentale (Dir. thèse : Dr. H. Hégaret, C. Fabioux, resp. scientifiques : M. Lassudrie, E. Fleury)
 

Et une de l’Université Fédérale de Rio de Janeiro (accomplie 2011-2015) : Raquel Neves : Dynamique et structure de population du gastéropode Heleobia australis dans un environnement tropical et eutrophisé », (dir. thèse : Dr. Jean Valentin, UFRJ)
Raquel est en poste d’ingénieur de recherche à l’UNIRIO à Rio de Janeiro (depuis 2015)

-Encadrement de 10 Master 1, 10 Master 2 et 2 stagiaires IUT entre 2005 et 2021

-Enseignement:

2021, 2020: Au sein du Master SBM (Sciences Biologiques Marines), UE : Intercaction entre organismes marins à l’IUEM-UBO (Université de Bretagne Occidentale): Cours magistraux sur les intercations entre microalgues toxiques et bivalves (2h)
2021, 2020, 2018, 2012, 2013: Au sein du Master SBM (Sciences Biologiques Marines), Spécialité : Valorisations biotechnologiques des ressources maritimes (VALBIOREM) à l’IUEM-UBO (Université de Bretagne Occidentale): Cours magistraux et TD sur l’allélopathie des microalgues. (4h/an)
2018: Universidade Federale de Paraiba, Joao Pessoa, Brésil: Cours magistraux et TP/TD sur l’utilisation de la cytomètrie en flux pour l’évaluation des réponses hémocytaires de bivalves. (10h)
2010-2017 : Evaluation des stages de Master 1 et Master 2 au sein du sein du Master SBM (Sciences Biologiques Marines) à l’IUEM-UBO (Université de Bretagne Occidentale) (entre 4 et 8 étudiants par an)
2016: Au sein du laboratoire de valorisation des microalgues (LARBIM), Universidade Federale de Paraiba, Joao Pessoa, Brésil: Cours magistraux et TP/TD sur l’analyse de la physiologie des microalgues à l’aide d’outils tels que la cytomètrie en flux et la fluoromètrie PAM. (40h)
2015: Au sein du laboratoire d’immunologie des invertébrés (LABIPI), Universidade Federale de Paraiba, Joao Pessoa, Brésil: Cours magistraux et TP/TD sur les réponses immunitaires de bivalves. (20h)
2010-2011: Au sein du Master SBM (Sciences Biologiques Marines) à l’IUEM-UBO (Université de Bretagne Occidentale): Cours magistraux sur les interactions en bivalves et microalgues toxiques (8h/an)
2008: ATER à l’IUT de Brest, TP de Biochimie (30h)
2008: ATER à l’IUT de Brest, TD d’anglais (80h)
2007: ATER à l’IUT de Brest, TP de sciences du sol/pédologie (36h)
2004: “Laboratory instructor” (cours de TP/TD en biologie) pour un semestre au niveau “undergraduate » (eq. Licence) “Biology 107” (65h), Univ. of Connecticut, USA
2003 and 2004: Laboratory instructor during the Milford Aquaculture Laboratory Algal Workshop (10h)
2003: Undergraduate-level courses in cellular and animal biology at the University of Connecticut (2h)
2002: Laboratory instructor in Master 1 in the University of Brest on use of flow cytometry (4h)

Prix et distinctions scientifiques:

- Membre des sociétés « Sigma-Beta-Kappa »; « Phi-Kappa-Phi » et « Sigma-Xi »
-“Team Member of the Year Award” NOAA, USA, 2007;
-Research awards: Carriker Student Research Grant, NSA 2007 and 2005 ($2000), -“Grants-in-Aid of Research”, Sigma Xi, 2006 ($1000), -Castagna Research Grant”, NSA, 2006 ($1000), -Lerner Grey, USA 2005 ($1000); -PreDoctoral Research Award, Graduate School of the Department of Marine Sciences, University of Connecticut, 2006 ($1240)
-Poster and presentation awards: International Pectinid Workshop, Canada 2007 and Australia 2005; EPA Science Forum Poster Award, session “Changing Environments”, USA 2006; World Aquaculture Society poster award, USA 2007; National Shellfisheries Association presentation and poster awards, USA 2006, 2005 and 2003
- Travel awards: « Ulysse » fellowship from France, 2002 (€1000); Student travel awards from National Shellfisheries Assoc. to attend their NSA Annual Meetings: 2003, 2005, 2006; Travel award from the NOAA Center for Sponsored Coastal Ocean Research, 2006 to attend the US Conference on Harmful Algae, 2006 ($1000);Feng Student Fund Research Award from University of Connecticut, 2006 ($1260); “Doctoral dissertation fellowship award” of the University of Connecticut, 2007 ($2000)

Responsabilités scientifiques:

 Animation et management de la recherche :

 -2014-2017 renouvelé pour 2018-2022: Directrice d’un Groupement de Recherche GdR 3659 national CNRS/IFREMER (en collaboration avec P. Hess IFREMER) intitulé « PHYCOTOX : Des microalgues aux risques pour l’Homme et l’écosystème » (env. 30-40k€/an, 140 personnes) : www.phycotox.fr. Ce GdR a pour but de de favoriser les échanges entre chercheurs pour mieux étudier non seulement les micro-algues, leur écologie, leur diversité et biologie, mais aussi les toxines qu’elles produisent, l’impact au niveau des organismes marins et des écosystèmes, ainsi que les conséquences potentielles aux niveaux sanitaire et socio-économique.
-2016-2021 : Responsable de la coordination de l’équipe 1 LEMAR du laboratoire des sciences et de l’environnement marin intitulée PANORAMA en collaboration avec C. Fabioux (UBO) et J. Zambonino (LEMAR) (env. 100 pers.)
-2017-2021 : Membre élue du conseil de laboratoire (CL) du LEMAR
-2012-2021 : Membre du comité scientifique (CS) du LEMAR
-2012-2016 : Responsable de la coordination de l’axe « Ecologie et physiologie des organismes photosynthétiques » au LEMAR en collaboration avec D. de la Broise
-2009-2012 : Responsable de l’organisation des séminaires du LEMAR

Participation à l’organisation de colloques et conférences nationales et internationales :

Oct. 2021 : Membre du comité scientifique de la conférence internationale sur les microalgues toxiques « International Conference on Harmful Algae » ICHA La Paz, Mexique, Oct 2021
Oct. 2018 : Membre du comité d’organisation de la conférence internationale sur les microalgues toxiques « International Conference on Harmful Algae » ICHA2018, Nantes en octobre 2018
Mar. 2017 : Membre comité d’organisation de la conférence nationale du GdR PHYCOTOX et GIS Cyano, sur les microalgues toxiques et les cyanobactéries, GIf Sur Yvette, 14-16 mars 2017 (100 personnes).
Mar. 2016 : Membre comité d’organisation de la conférence nationale du GdR PHYCOTOX, sur les microalgues toxiques, Villefranche sur Mer, 15-16 mars 2016 (70 personnes).
Mar. 2015 : Organisatrice de la première conférence nationale sur les microalgues toxiques et les cyanobactéries, du GdR PHYCOTOX et GIS Cyano, IUEM, Plouzané du 31 mars au 2 avril 2015 (140 personnes).
Oct. 2014 : Organisatrice d’un des cinq volets intitulé « Coastal Management : Ecology and Biodiversity » du colloque franco-brésilien « Building the Marine Science » à Brest lors de la Sea Tech Week.
Janv. 2014 : Membre comité d’organisation du colloque sur les microplastiques, Brest.
Nov. 2013 : Organisatrice d’un des cinq volets intitulé « Biologie, Ecosystème, Pêche et Santé » du colloque franco-brésilien « Building Marine Science » Buzios, Brésil.
Mars 2014 : Organisatrice d'une session spéciale «impact du seston toxique (bio et abio-seston) sur les consommateurs primaires » lors de la conférence internationale « National Shellfisheries Association » Jacksonville, USA
Mars 2012 : Organisatrice d'une session spéciale «algues toxiques», conférence internationale « World Aquaculture Society et National Shellfisheries Association » Seattle, USA
Nov. 2007 : Organisatrice d’un "Atelier Sur Les interactions entre hétérotrophes unicellulaires» à Brest
Sept. 2005 : Membre du comité d'organisation de la "Conférence internationale sur la restauration des Coquillages (ICSR)" à Brest, France
2002 : Membre du comité d'organisation des Rencontres Halieutiques, conférence nationale, Rennes, France