UMR1078

UMR 1078
Genetics, functional genomics
and biotechnology

Expression et épissage des gènes dans les cellules somatiques - équipe dirigée par Laurent Corcos

Sommaire

Introduction

La voie du cholestérol

Analyse de l’expression des gènes dans les cancers de l’estomac et du côlon

Les cellules souches cancéreuses

Analyse de l’effet de la combinaison thérapeutique statine/taxane sur la croissance tumorale chez les souris immunodéprimées

Analyse d'images et prédiction de réponse aux thérapies

Contacts

 


Introduction

Notre équipe ECLA (Epissage-Cancérologie-Lipides-Apoptose), au sein de l’UMR INSERM 1078, s’intéresse à deux axes principaux, en lien avec les altérations génétiques et métaboliques survenant dans le développement cancéreux.

D’une part, nous étudions en quoi le blocage de la voie de synthèse du cholestérol par les statines peut engager les cellules cancéreuses vers l’apoptose. L’objectif de ces travaux est de construire un modèle de Biologie Systémique qui soit simulable, permettant de prédire le taux d’engagement des cellules dans l’apoptose en fonction du niveau de blocage de la voie. Ces études sont menées en collaboration avec la Société Dassault Systèmes Informatiques. L’une des perspectives poursuivies est de nous intéresser à l’effet cumulé de l’association entre statines et anticancéreux. Nous avons par exemple démontré que l’association entre la lovastatine et le docétaxel - un taxane bloquant la repolymérisation des microtubules - provoque une augmentation synergique de l’apoptose de cellules cancéreuses gastriques humaines (Brevet associé). Un modèle animal est actuellement à l’étude.

D’autre part, nous analysons le remodelage du transcriptome dans les étapes précoces de la cancérogenèse colorectale chez l’Homme. Nous étudions les mécanismes conduisant à l’épissage alternatif, au contrôle exercé par les micro-ARN et par les autres acteurs épigénétiques, et au couplage entre transcription et épissage. L’objectif principal de cet axe est d’identifier de nouveaux marqueurs pronostiques et/ou prédictifs, identifiés dès les stades précoces (adénomes polypoïdes) de la transformation cancéreuse et, plus récemment, dans les syndromes myéloprolifératifs et myélodisplasiques.

Plusieurs projets complémentaires sont également étudiés, portant sur les cellules souches cancéreuses du colon, et sur le lien entre des images de TEP-CT et le transcriptome (collaboration avec l’UMR INSERM 1101).


La voie du cholestérol

Résumé de la thématique

Dans le cadre du programme BioIntelligence (dont le chef de file est Dassault Systèmes), nous analysons la réponse intégrée de lignées cellulaires cancéreuses à un blocage de la voie de synthèse du cholestérol par les statines, qui sont des hypocholestérolémiants majeurs, capables d’induire l’apoptose d’un grand nombre de cellules cancéreuses. Ce blocage conduit à une perte de sensibilisation des cellules aux facteurs de croissance capables de mobiliser les protéines de la famille de Ras, Rho, Rab, Rac, cdc42, (etc.), qui requièrent une modification post-traductionnelle (prénylation) par des chaînes carbonées (C15, farnésyl-pyrophosphate ou C20, géranyl-géranyl-pyrophosphate) produites dans la voie de synthèse du cholestérol. Sous l’effet des statines et des combinaisons thérapeutiques associant les statines et des anticancéreux, nous analysons les conséquences du blocage de la voie en mesurant plusieurs activités enzymatiques, les taux des métabolites, les taux des ARN messagers, les taux des protéines, l'activation des protéines Ras et Rho (etc.), le taux d’apoptose, etc. Ces données quantitatives sont incorporées dans un modèle bioinformatique destiné à simuler les comportements cellulaires et subcellulaires induits par les traitements.

Personnels impliqués

Laurent Corcos, DR2, Inserm
Catherine Le Jossic-Corcos, MCU, UBO
Jean-Philippe Metges, PH, CHRU
Danielle Arzur, TR, UBO
Brigitte Simon, TR, UBO

Collaborations

Elisabeth Pécou-Gambaudo, Dassault Systems, Sophia Antipolis


Analyse de l’expression des gènes dans les cancers de l’estomac et du côlon

Résumé de la thématique

Nous analysons les taux d'expression et l’épissage alternatif de certains gènes impliqués dans le développement tumoral et la réponse aux thérapies ciblées, y compris anti-angiogéniques, à la fois dans des cellules cancéreuses et dans des prélèvements de bas ou de haut grade dans les cancers du l’estomac et du côlon.

Personnels impliqués

Laurent Corcos, DR2, Inserm
Catherine Le Jossic-Corcos, MCU, UBO
Brigitte Simon, TR, UBO
Marion Flodrops, Doctorante, UBO (depuis le 01/10/2014)
Stéphanie Durand, ATER, UBO (Ancien membre)
Gaël Quéré, Doctorant, UBO (depuis le 01/10/2016)
Arnaud Uguen, CHRU de Brest
Michel Robaszkiewicz, CHRU de Brest
Laurent Doucet, CHRU de Brest

Collaborations

Cédric Le Maréchal, PU-PH, CHRU de Brest, EFS
GenoSplice technology, Evry
Service d’anatomie pathologique du CHRU de Brest
Service d’hépato-gastroentérologie du CHRU de Brest
Plate-forme Génomique Santé, Biosit Rennes


Les cellules souches cancéreuses

Résumé de la thématique

Nous analysons dans les cellules souches cancéreuses digestives, l’expression et l'épissage alternatif de gènes impliqués dans les voies de cancérisation et de métastases, à partir de lignées tumorales établies et de tumeurs cancéreuses humaines, dans le but d’identifier de nouveaux marqueurs prédictifs des réponses thérapeutiques et de la progression métastatique.

Personnels impliqués

Laurent Corcos, DR2, Inserm
Catherine Le Jossic-Corcos, MCU, UBO
Brigitte Simon, TR, UBO
Stéphanie Durand, ATER, UBO (Ancien membre)
Marion Flodrops, Doctorante, UBO

Collaborations

Pierre-François Cartron, Inserm U892 CRCNA, Nantes


Analyse de l’effet de la combinaison thérapeutique statine/taxane sur la croissance tumorale chez les souris immunodéprimées

Résumé de la thématique

Dans le cadre du projet STATAX, nous analysons l’effet thérapeutique d’une association médicamenteuse entre un anticancéreux et un hypocholestérolémiant sur des souris immunodéprimées porteuses de tumeurs issues de cellules cancéreuses gastriques humaines (lignée HGT-1). Ce bénéfice thérapeutique a déjà été démontré en culture in vitro et fait l’objet d’un brevet. L’objectif de ce projet est d’étendre nos observations à des analyses précliniques chez la souris.

Personnels impliqués

Laurent Corcos, DR2, Inserm
Catherine Le Jossic-Corcos, MCU, UBO
Stéphanie Durand, ATER, UBO (Ancien membre)
Loann Raud, Etudiant M2 GGB, UBO

Collaborations

Kilian Trillet, CRCNA Nantes
Séverine Loisel, Animalerie de l’UBO


Analyse d'images et prédiction de réponse aux thérapies

Résumé de la thématique

Nous analysons des images TEP (tomographie par émission de positons) dans le contexte de la progression tumorale et de la réponse aux thérapeutiques des cancers ORL.

Personnels impliqués

Laurent Corcos, DR2, Inserm
Brigitte Simon, TR, UBO

Collaborations

Florent Tixier, CHRU de Poitiers
Catherine Cheze-Le Rest, CHRU de Poitiers
Dimitris Visvikis, Inserm UMR1101, UBO
Service d’ORL du CHRU de Brest
Service de radiothérapie du CHRU de Brest


Contacts

Thème dirigé par Laurent CORCOS 

Laurent CORCOS (DR2, INSERM) (Pubmed)
Tél : +33 (0)2 98 01 83 01
Fax : +33 (0)2 98 01 83 22
laurent.corcos@univ-brest.fr

 
 

Catherine LE JOSSIC-CORCOS (MCU, UBO) (Pubmed)
Tél : +33 (0)2 98 01 79 02
Fax : +33 (0)2 98 01 83 22
catherine.corcos@univ-brest.fr

 
 

Stéphanie DURAND (ATER, UBO)(Ancien membre)
Tél : +33 (0)2 98 01 64 67
stephanie.durand@univ-brest.fr
 


 

Flaria EL KHOURY (doctorante, UBO)(Ancien membre)
Tél : +33 (0)2 98 01 64 67
felkhoury@univ-brest.fr
(thése soutenue le 18/12/2015)


 

Gaël Quéré (Doctorant, UBO)
Tél: +33 (0)2 98 01 64 67
gael.quere@univ-brest.fr

 

 

Jean-Philippe METGES (PH associé, CHRU) (Pubmed)
Tél : +33 (0)2 98 22 33 95
Fax : +33 (0)2 98 22 33 23
jean-philippe.metges@chu-brest.fr
 

 

Marion FLODROPS (Doctorante, UBO)
Tél : +33 (0)2 98 01 64 67
marion.flodrops@univ-brest.fr

 
 


Brigitte SIMON (TR, UBO)
Tél : +33 (0)2 98 01 64 55
brigitte.simon@univ-brest.fr

 
 


Danielle ARZUR (TR, UBO)
Tél : +33 (0)2 98 01 64 55
danielle.arzur@univ-brest.fr
 

 

 

Arnaud Uguen (MCU-PH, UBO-CHRU de Brest)
Tel + 33 298 223 349
Fax: + 33 298 223 334
arnaud.uguen(at)chu-brest.fr