UMR1078

UMR 1078
Genetics, functional genomics
and biotechnology

EQUIPEMENTS

MICROSCOPIE

> microscope à fluorescence (Olympus)

  • Technologie :
  • microscope droit à fluorescence avec filtres Rhodamine/Phalloidine, FITC et DAPI, objectifs x40 et x60 à immersion.
  • Location :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO.
  • Contact : Pr  Marc Blondel
  • Tel: +33(2) 98 01 83 88
    eMaill: marc.blondel(at)univ-brest.fr

 

> microscope à dissection de tétrades (Singer)

  • Technologie :
  • microscope à dissection motorisé pour isoler des diploides ou dissequer des tétrades de levure.
  • Localisation :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contact :  Pr Marc Blondel
  • Tel: +33(2) 98 01 83 88
    Mel: marc.blondel(at)univ-brest.fr

 

> microscope à dissection laser (PALM Robot Micro Beam)

  • Technologie :
  • Laser associé à un microscope inversé et une caméra, le tout piloté par un système informatique. Découpe et séparation de types cellulaires ou de territoires à partir de coupes congelées ou traitées.
  • Localisation :
  • Laboratoire de génétique Moléculaire (CHRU Brest)
  • Contact : Pr Le Marechal
  • Tel: +33(2) 29 020 150
    Mel: cedric.lemarechal(at)univ-brest.fr

 

IMAGERIE IN VIVO (BIOLUMINESCENCE ET DE FLUORESCENCE)

> Système d’Imagerie in vivo (NightOWL II LB 983 NC 100; Berthold)

  • Technologie :
  • Etude de l’expression de gène in vivo par bioluminescence ou par fluorescence. Localisation au moyen d'anticorps marqués ou de formulations fluorescents. Bio distribution et cinétique d'expression et de localisation.
  • Localisation :
  • Animalerie de l’UBO
  • Contact : Pr Tristan Montier
  • Tel : 02 98 01 80 80
    Mail : tristan.montier(at)univ-brest.fr

 

AUTOMATE DE BIOCHIMIE, HÉMATOGRAMME, IONOGRAMME

> Automate de Biochimie (Selectra E ; ELITech)

  • Technologie :
  • Automate pour analyse biochimique sur sérum, plasma, etc…
  • Localisation :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contact : Pr  Tristan Montier
  • Tel : 02 98 01 80 80
    Mail : tristan.montier(at)univ-brest.fr

 

> Hématogramme (MS9-5H ; ELITech)

  • Technologie :
  • Compteur analyseur d’Hématologie numérique
  • Localisation :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contact : Pr Tristan Montier
  • Tel : 02 98 01 80 80
    Mail : tristan.montier(at)univ-brest.fr

 

> Ionogramme (Easy Electrolytes; ELITech)

  • Technologie :
  • Analyseur quantitatif direct du sodium, du potassium et du chlore ou du lithium dans des échantillons de sérum, plasma, sang total et urine
  • Localisation :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contact : Pr Tristan Montier
  • Tel : 02 98 01 80 80
    Mail : tristan.montier(at)univ-brest.fr

 

LECTEUR MICROPLAQUE MULTIMODE

> Flex-Station-3 (Molecular Devices©)

  • Technologie : La Flex-Station-3 (Molecular Devices©) est un lecteur de microplaques à 5 modes pour un large spectre d’applications biochimiques et cellulaires, pour l'absorbance, l'intensité de fluorescence, la polarisation de fluorescence, des tests de fluorescence en temps résolu et des tests de luminescence
  • Localisation : Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contacts :
    Dr Olivier Mignen (responsable scientifique)
    Tél : +33(0)2 98 01 67 05
    Mail : olivier mignen(at)univ-brest.fr 

    Dr Patrick Robert (responsable technique)
    Tél : 02 98 01 81 01
    Mail : patrick.robert(at)univ-brest.fr 

 

CHROMATOGRAPHIE

> chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC/MS), mode IC et mode IE (Agilent Technologies)

=

  • Technologie :
  • chromatographies en phase gazeuse couplées à la spectrométrie de masse (GC/MS) : mode Ionisation Chimique (IC) et mode Impact Electronique (IE)
  • Localisation :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contact : Dr Laurent Corcos
  • Tel: +33(2) 98 01 83 01
    Mel: laurent.corcos(at)univ-brest.fr

 

> chromatographie en phase liquide (HPLC), détecteur fluorescence (1260 Infinity, Agilent Technologies)

  • Technologie :
  • chromatographie en phase liquide (HPLC), détecteur fluorescence (1260 Infinity, Agilent Technologies). Autre matériel : HPLC, détecteur UV ou radioactivité
  • Localisation :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contact : Dr Laurent Corcos
  • Tel: +33(2) 98 01 83 01
    Mel: laurent.corcos(at)univ-brest.fr

 

PCR TEMPS RÉEL (QPCR) ET HRM

> ABI 7000 et ABI 7300 (Applied Biosystems)

  • Technologie :
  • Techniques de quantification d'acides nucléiques ou de screening de variations
  • Localisation :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contact : Dr Laurent Corcos
  • Tel: +33(2) 98 01 83 01
    Mel: laurent.corcos(at)univ-brest.fr

 

> Chromo4 (Bio-Rad)
  • Technologie :
  • Techniques de quantification d'acides nucléiques ou de screening de variations
  • Localisation :
  • Laboratoire de génétique Moléculaire (CHRU Brest)
  • Contact : Pr Le Marechal
  • Tel: +33(2) 29 020 150
    Mel: cedric.lemarechal(at)univ-brest.fr

 

> Light Cycler 480 (Roche)
  • Technologie :
  • Techniques de quantification d'acides nucléiques (qPCR) ou de criblage de variations par courbes de fusions haute résolution (HRM)
  • Localisation :
  • Laboratoire de génétique Moléculaire (CHRU Brest)
  • Contact : Pr Le Marechal
  • Tel: +33(2) 29 020 150
    Mel: cedric.lemarechal(at)univ-brest.fr

 

> Light Scanner (Idaho Technologies Inc)
  • Technologie :
  • Courbe de fusion à haute résolution (HRM) pour génotypage ou criblage de mutations 
  • Localisation :
  • Laboratoire de génétique Moléculaire (CHRU Brest)
  • Contact : Pr Le Marechal
  • Tel: +33(2) 29 020 150
    Mel: cedric.lemarechal(at)univ-brest.fr

 

EXTRACTEUR ADN/ARN

> QIAcube (QIAGEN)

test

  • Technologie :
  • Automate pour la purification des ADN, ARN ou protéines (utilisation des kits QIAGEN)
  • Localisation :
  • Faculté de Médecine et des Sciences de la Santé de l'UBO
  • Contact : Dr Laurent Corcos
  • Tel: +33(2) 98 01 83 01
    Mel: laurent.corcos(at)univ-brest.fr

 

GENOMIQUE - TRANSCRIPTOMIQUE

> Séquenceur Haut-débit (PGM Ion Torrent, Life Technologies)

  • Technologie :
  • puces semi-conducteurs avec pHmètre intégré. Adaptation du pyroséquençage. Trois formats de puces (10Mbases à 1Gbases)
  • Localisation :
  • Laboratoire de génétique Moléculaire (CHRU Brest)
  • Contact : Pr Le Marechal
  • Tel: +33(2) 29 020 150
    Mel: cedric.lemarechal(at)univ-brest.fr

 

> Séquenceur Haut-débit (Proton, Life Technologies)

test

  • Technologie :
  • puces semi-conducteurs avec pHmètre intégré. Adaptation du pyroséquençage. Puce Proton I (jusqu'à 10 Gbases)
  • Localisation :
  • Laboratoire de génétique Moléculaire (CHRU Brest)
  • Contact : Pr Le Marechal
  • Tel: +33(2) 29 020 150
    Mel: cedric.lemarechal(at)univ-brest.fr

 

> Scanner puces à ADN (Agilent Technologies Inc)

test

  • Technologie :
  • Scanner de puces pour CGH-array, transcriptome, méthylation ou ChIP-chip. Lecture à partir de 2µm.
  • Localisation :
  • Laboratoire de génétique Moléculaire (CHRU Brest)
  • Contact : Redon Sylvia
  • Tel: +33(2) 29 020 150
    Mel: sylvia.quemener(at)chu-brest.fr

 

> Séquenceurs capillaires (Applied Biosystems)

  • Technologie :
  • analyses de réactions de séquençage de type Sanger ou de fragments (type microsatellites ou amplicons). Trois appareils disponibles : ABI3130XL (16 capillaires), ABI3500 (8 capillaires), ABI3130 (4 capillaires).
  • Localisation :
  • Laboratoire de génétique Moléculaire (CHRU Brest)
  • Contact : Pr Le Marechal
  • Tel: +33(2) 29 020 150
    Mel: cedric.lemarechal(at)univ-brest.fr