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LBAI
Lymphocytes B et Autoimmunité
UMR 1227

Plate-Forme d'épigénétique - EpiGenBrest

En relation étroite avec le projet BiogenOuest et eBiogenOuest, la plateforme EpiGenBrest constituera, au sein de l'UBO, une plateforme ouverte d’étude du génome et de l’épigénome basée sur les nouvelles technologies de séquençage à haut débit pour l’étude des maladies multifactorielles et des organismes marins en interaction avec leur environnement biotique et abiotique. Cette plateforme a pour ambition de mettre à disposition des équipes de recherche de l’UBO les outils et les compétences pour mener à bien leurs projets d’envergure nationale ou internationale. Elle sera dimensionnée pour mettre en œuvre des projets de moyen débit de séquençage dans les domaines de la biologie - santé et de la biologie marine.


Outre les équipes du CBRBS et notamment IPaB et BIG, d'autres équipes ont montré un fort intérêt pour utiliser cette plateforme. Ces équipes sont : UMR6539 LEMAR (Laboratoire des sciences de l’Environnement MARin, LabexMer Axes 2 et 6), UMR6197 LMEE (Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, LabexMer Axe 3), EA3882 LUBEM (Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne), EA4685 LNB (Laboratoire des Neurosciences de Brest), EA3878 GETBO (Groupe d'étude de la thrombose de Bretagne occidentale), LBCM Lorient (UBS) et l'IBSAM. Les équipements de cette plateforme seront mutualisés pour réaliser des opérations fines de tri cellulaire, étudier la biodiversité au niveau génomique, préparer les librairies en amont des séquenceurs que dispose Biogenouest, stocker et analyser les données, permettre des opérations de génotypage et de phylotypage haut débit, et analyser les marqueurs épigénétiques (profil de méthylation) et phylogénétique.