5 thèmes de recherche inter-connectés

LBAI
Lymphocytes B et Autoimmunité
UMR 1227

Nouvelles approches en Immunothérapie

L’UMR 1227, seul partenaire académique français sur les 28 du consortium, est impliquée dans plusieurs work packages (WP) : WP1 “Coordination”, WP2 “Sample Collection and Biobanking”, WP3 “Clinical Data Management”, WP5 “Flow Cytometric Analysis and Cellular Separations from blood of patients with SADS and pre-clinical models” (WP leader: J.O. Pers), WP6 “Proteomics, Metabolomics and Serology of SADS”, WP8 “Data Analysis- Bioinformatics and Biostatistics” et WP9 “Knowledge Dissemination and Training”. JO Pers est membre du Comité de pilotage de Precisesads. Budget global: 22.8 millions €, Budget spécifique EA2216 : 834 400€.

Le laboratoire a en charge le WP5 dédié à la cytométrie et au tri cellulaire.
Les objectifs sont les suivants :

1- Valider une méthode de déconvolution combinant la répartition des différentes sous-populations cellulaires du sang identifiées par cytométrie de flux avec l'expression des gènes et les profils épigénomiques observés chez les mêmes patients atteints de différentes MAI,

2- Mettre en corrélation des signatures « OMIQUES » avec la distribution des sous-populations cellulaires obtenue par cytométrie en flux,

3- Identifier, à travers une fine analyse par cytométrie en flux , une nouvelle population cellulaire spécifique à une MAI,

4- Optimiser les logiciels d'analyse existants (FLOCK, VisNE, SPADE),

5- Réaliser une taxonomie de la distribution des sous-populations cellulaires dans les MAI,

6- Proposer un test facile à utiliser en routine (cytométrie de flux) aidant à la classification des MAI et à valider la nouvelle classification issue des signatures « OMIQUES »,

7- Valider par cytométrie en flux de nouveaux biomarqueurs identifiés par les techniques « OMIQUES ».