ALAIN Karine

Chargée de Recherche de 1ère classe (CNRS)
Microbiologiste


Chercheur
Etablissement : Université Bretagne Occidentale
Affectation de recherche : LM2E (Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmes)

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Page personnelle :

ETAT CIVIL

Nom patronymique : ALAIN
Prénom : Karine
Date et lieu de naissance : née le 4 janvier 1976
Situation de famille : Pacsée, 1 enfant
Adresse professionnelle : Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM)
UMR 6197 (UBO-CNRS-Ifremer)
Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes (LM2E)
Technopôle Brest Iroise, 29280 Plouzané
Tél.  02 98 49 88 53
Courriel : Karine.Alain@univ-brest.fr
 

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FONCTION ACTUELLE

Chargée de Recherches de 1ère classe (CR1) au CNRS, HDR. Section 29 : Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés.
Spécialité : Microbiologie, écologie microbienne des environnements marins extrêmes.

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SYNOPTIQUE : PARCOURS

- Depuis 2011 / CR1 Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes (Directeur : M. Jebbar), IUEM, Brest.

- 2007 -2011/ CR2 Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes (Directeur : D. Prieur puis A. Godfroy), IUEM, Brest.

- 2006-2007 / ATER Observatoire Océanologique (Directeur : P. Lebaron), Banyuls-sur-mer.

- 2004-2006 / Post-doc Institut Max-Planck de Microbiologie Marine, département de Microbiologie (Directeur : F. Widdel), Brême, Allemagne.

- 2000-2003 / Doctorat Université de Bretagne Occidentale, Brest, France – Ifremer, laboratoire de Microbiologie et de Biotechnologie des Extrêmophiles (Directeur : J. Querellou), Brest.
 

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FORMATION ET TITRES UNIVERSITAIRES

- Juin 2014 : Habilitation à Diriger des Recherches, Université de Bretagne Occidentale, Brest, France.
Sujet : « Biosphère microbienne des habitats marins extrêmes : Contribution à l’étude de la diversité, des fonctions, des limites géographiques et des interactions avec l’environnement ».

- Oct. 2000/Oct. 2003 Doctorat en Microbiologie Fondamentale et Appliquée, Université de Bretagne Occidentale, BREST (29). Thèse réalisée à l’Ifremer, dans le laboratoire de Microbiologie et de Biotechnologie des Extrêmophiles (DRV/VP/MBE ancien CMM), à Plouzané (29). Directeur de thèse : Prof. F. Duchiron (Université de Reims). Allocataire d’une bourse Ifremer.
Sujet: « Approches culturales et moléculaires des assemblages microbiens associés aux polychètes hydrothermaux de la famille Alvinellidae ». Thèse soutenue le 03/10/2003. Mention très honorable avec les félicitations du jury.

- 1999/2000 Diplôme d’Etudes Approfondies de microbiologie fondamentale et appliquée – DEA co-habilité par les universités de CAEN, RENNES et BREST. « Isolement et caractérisation d’une bactérie abyssale baro-thermophile d’un nouveau genre ». Mention Bien.
 

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RESPONSABILITES COLLECTIVES

Responsabilités administratives locales

• A partir de 2016 : Animatrice du thème 2 « Caractérisation et activités des acteurs microbiens des écosystèmes extrêmes profonds » de l’UMR6197
• Depuis 2015 : Membre élue du conseil de laboratoire de l’UMR6197
• 2009-2015 : Assistante de prévention de l’UMR6197
• Depuis 2014 : Membre du bureau de l’IUEM
• Depuis 2007 : Membre du conseil scientifique de l’UMR6197
• Depuis 2007 : Membre de la commission ‘Locaux’ de l’IUEM

 Responsabilités administratives nationales

• 2016-2019 : Co-coordinatrice de l’axe 3 « Interactions géobiologiques dans les environnements extrêmes » du laboratoire d’excellence LabexMER « L’océan dans le changement » regroupant 11 unités d’excellence du grand ouest.

 • Depuis 2010 : Membre du conseil d’administration de l’AFEM (Association Francophone d’Ecologie Microbienne). Secrétaire de l’AFEM depuis 2013. Co-rédactrice du e-mensuel d’information « La Lettre de l’AFEM » (4-5 pages) depuis septembre 2015.

• 2010-2012 : Membre nommée de la section 29 (Biodiversité, évolution et adaptations biologiques :
des macromolécules aux communautés) du CNRS (NOR : ESRR1000407A, arrêté du 24-11-2010, ESR - DGRI-SPFCO-B2)

• 2008-2010 : Membre suppléante de la commission nationale ‘Flotte et engins’, comité ‘Evaluation’ : Evaluation des campagnes océanographiques de la flotte française.

 Responsabilités administratives internationales

• 2018-2021 : Directrice française du Laboratoire International Associé MICROBSEA, Laboratoire franco-chinois de microbiologie des grands fonds ". Ce laboratoire franco-chinois est centré sur la microbiologie des sources hydrothermales. Il associe 2 laboratoires:
- LM2E Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, UMR6197 CNRS/Ifremer/Université de Bretagne Occidentale, IUEM, Plouzané, France. Directrice française : Dr. K. ALAIN
- KLMBR State Key Laboratory of Marine Biogenetic Resources; Key Laboratory of Marine Biogenetic Resources, Third Institute of Oceanography, SOA, Xiamen, China. Directeur chinois : Prof. Z. SHAO