L'objectif de ce projet est d'étudier la faisabilité de nouvelles méthodologies d’analyse du métabolome (petites molécules issues du métabolisme) de végétaux du genre Allium (oignons, ails, échalotes)¹ en utilisant la spectrométrie de masse, la mobilité ionique en phase gazeuse et les algorithmes d'apprentissage automatique (Intelligence Artificielle). 

Il s’agit de développer des méthodes de caractérisation automatisées permettant de distinguer les différentes variétés d’alliums en fonction de leur composition en substances bioactives (telles que les polyphénols ou les organosoufrés) et d’évaluer l’influence des conditions de culture sur leur production de métabolites d’intérêt afin d’en valoriser les propriétés bénéfiques pour la santé (diminution des risques de cancers, de maladies neuro-dégénératives et cardio-vasculaires, de diabètes et de développement d’obésité)². La collaboration entre nos laboratoires, initiée dans le cadre de ce projet, permettra de rendre les résultats d’analyse, réalisées au CEMCA³, plus robustes par un meilleur contrôle des conditions de culture et en travaillant avec des variétés certifiées issues de graines ou clonales, en bénéficiant de l’expertise en biologie végétale et des infrastructures du laboratoire Géoarchitecture.

Cette approche métabolomique pourra ainsi être comparée, et utilisée de manière complémentaire, à l’approche génomique qui est actuellement utilisée par les professionnels (associations de producteurs) et institutions du Finistère (chambre d’agriculture). De manière plus générale, il apparaît que cette approche n’a, en effet, été que très peu utilisée sur les espèces et variétés d’Allium locales françaises.

Si les résultats sont probants, ils pourront être mis en commun avec ces partenaires potentiels afin de complémenter nos connaissances et mieux valoriser les productions locales. Les résultats attendus constituent donc une nouvelle source d’information permettant une meilleure valorisation des productions locales, notamment par l’obtention de labels de qualité (AOP, IGP, STG …) qui ont un véritable impact sur l’économie locale. A titre d’exemple, la production/vente d'oignons de Roscoff a augmenté de manière significative depuis l'obtention du statut d'AOP, passant de 210 tonnes en 2009 à plus de 4 100 tonnes en 2018. Par ailleurs, une meilleure connaissance des contenus métaboliques peut également être utilisée afin de détecter des fraudes à la vente, permettant ainsi de mieux protéger nos variétés locales d’une concurrence potentiellement déloyale.⁴

1. Puizina J., Javornik B., Bohanec B., Schweizer D., Maluszynska J., Papeš D., Genome, 1999, 1208–1216, DOI:10.1139/gen-42-6-1208.
2. Wan Q., Li N., Du L., Zhao R., Yi M., Xu Q., Zhou Y., Food Sci. Nutr., 2019, 2451, DOI:10.1002/FSN3.1117.
3. V.González-de-Peredo A., Maroto A., Barbero G.F., Memboeuf A., Chemosensors, 2024, 12 (7), 130, DOI:10.3390/chemosensors12070130; V.González-de-Peredo A., Maroto A., Memboeuf A., Microchemical Journal, 2025, 114445, DOI:10.1016/j.microc.2025.114445; V.González-de-Peredo A., Maroto A., Memboeuf A., Food Analytical Methods, 2026, 114445, DOI:10.1007/s12161-026-03061-4;
4. Biancolillo A., Aloia R., Rossi L., D’Archivio A.A., Food Control, 2022, 131, DOI:10.1016/j.foodcont.2021.108477.