Laboratoire Universitaire de Biodiversité et d'Ecologie Microbienne

Laboratoire Universitaire
de Biodiversité
et d'Ecologie Microbienne

Savoir faire / Equipement

Le laboratoire dispose de différents locaux et matériels dédiés :

  • Laboratoires et équipements de microbiologie (dont Maldi-ToF)
  • Laboratoires et équipements de biologie moléculaire (dont PFGE, TTGE, CE-SSCP, D-HPLC, Q-PCR)
  • Laboratoires et équipements de biochimie (dont IRTF, protéomique 2D, GC, LC-Q-ToF)
  • Laboratoires de culture cellulaire (étude toxicologique)
  • Compétences en modélisation, microbiologie prévisionnelle

D’autre part, le LUBEM s’appuie sur les compétences et outils des Services communs de l’UBO (Collection de micro-organismes / UBOCC, microscopie, spectrométrie de masse, RMN) et de Biogenouest (séquençage-génotypage, pyroséquençage, protéomique, bio-informatique et puces à ADN).

Savoir-faire :

Microbiologie / Mycologie / Biochimie / Biologie Moléculaire / Culture Cellulaire / Toxicologie / Chimie

  • Cultures bactériennes, Cultures de champignons filamenteux, Cultures cellulaires
  • Clonage-Séquençage
  • Caractérisation structurale et fonctionnelle
  • Electrophorèse bidimensionnelle
  • ELISA
  • Bioinformatique: analyse des données des NGS (Next Generation Sequencing), analyses des séquences, phylogénie
  • Isoelectrofocalisation
  • Microbiologie prévisionnelle
  • Mutagénese dirigée
  • PCR, PCR en temps réel (quantitative, en point final, multiplexes)
  • Protéomique
  • Purification de Biomolécules
  • Pyroséquençage
  • Spectrométrie de masse
  • Techniques de typage moléculaire : MLST, ECP, VNTR, …

Equipements :

  • Appareils Q-PCR
  • Bioréacteurs
  • Coriolis Air Sampler (impacteur d'air sur milieu liquide)
  • Cytomètres de flux
  • CPG, HPLC,UPLC,LC/MS/MS
  • Appareils PCR-Gradients
  • Multiphor II (Isoelectrofocalisation, et électrophorèse 1D)
  • Analyseur de gel Geldoc XR+Biorad
  • HPLC
  • LC-Q-ToF
  • Spectromètre de masse MALDI-TOF

Contacts

lubem@univ-brest.fr                                                                                                                                

Secrétariat Plouzané :

Marielle.LeGuen@univ-brest.fr
Tél. : 02 90 91 51 11

Secrétariat Quimper :

lisa.martin@univ-brest.fr
Tél. : 02 98 90 85 58