Laboratoire Universitaire de Biodiversité et d'Ecologie Microbienne

Laboratoire Universitaire
de Biodiversité
et d'Ecologie Microbienne

Présentation du LUBEM

 

Bienvenue sur le site du LUBEM (EA3882).

Le LUBEM est le Laboratoire Universitaire de Biodiversité et d’Ecologie Microbienne, Equipe d’Accueil n°3882.

Le LUBEM est un laboratoire de recherche de l’Université de Bretagne Occidentale spécialisé dans l’étude de la biodiversité et de l’écologie des microorganismes, et ce principalement en agro-alimentaire et en environnement.
Le LUBEM est une EA reconnue par le MESRI au titre du contrat quinquennal 2016-2021, et sa stratégie et son projet à 5ans ont été jugés Excellents par l'HCERES en 2016.
Il regroupe les activités de recherche en microbiologie de l’UBO (Université de Brest) rattachées à l’Ecole Doctorale EGAAL (ED 600) « Écologie, Géosciences, Agronomie, ALimentation » au sein de l'Université Bretagne-Loire.
Le laboratoire est associé à l'ADRIA Développement (Quimper) au sein de l’UMT SPORE-RISK (2013-2018) et est membre de l'Institut Brestois Santé- Agro- Matière (IBSAM).

Le LUBEM est une composante du Tremplin Carnot AgriFood Transition depuis 2016.

Le LUBEM regroupe des membres de différentes composantes d’enseignement :

Le schéma directeur du LUBEM est le suivant :

 

Le LUBEM a 2 axes applicatifs :

  • Ecosystèmes à composantes fongiques (moisissures et levures).
  • Etude des risques sanitaires et d'altérations associés à la physiologie des bactéries sporulées.

Les travaux de ses équipes sont structurés selon 4 domaines d’études communs aux 2 axes applicatifs:

  • Ecologie : identification, quantification et caractérisation des micro-organismes associés aux écosystèmes d’intérêt (agriculture, aliment et environnement marin), évolution des communautés microbiennes lors des variations de leur environnement.
  • Physiologie : comportement des microorganismes sous l’effet de de facteurs biotiques et abiotiques (dont approche de microbiologie prévisionnelle).
  • Métabolisme : rôle des microorganismes dans leurs écosystèmes, étude de métabolites à impact négatif ou positif (dont impact toxicologique) et de leurs voies de biosynthèse.
  • Maîtrise : application de méthodes physico-chimiques et biologiques pour le contrôle de microorganismes indésirables (microorganismes d’altération et pathogènes).

L’étude de la biodiversité des microorganismes et de leur écologie constituent des thèmes communs aux membres du laboratoire comme son nom l’indique.

Organisation et composition de l’équipe :

Le LUBEM est présent sur 2 sites géographiques (Plouzané et Quimper) et est structuré en 2 groupes  de recherche correspondants aux 2 axes applicatifs décrits ci-dessus.

Directeur du LUBEM - EA3882: Pr. Emmanuel COTON

Groupe 1. ESIAB, Plouzané, Axe "Ecosytèmes fongiques"

Responsable :  Pr Jérôme MOUNIER
Mots clés : Champignons filamenteux, Bactéries, Agro-alimentaire et Environnement

Groupe 2, IUT-ESIAB, Quimper, Axe "Bactéries sporulées"

Responsable : Pr Louis COROLLER
Mots clés : Microbiologie prévisionnelle, dynamique des populations microbiennes, antimicrobiens, Agro-alimentaire et Environnement

L’effectif au 1 janvier 2018 de l’EA3882 est constitué d’enseignants-chercheurs universitaires (5 PR, 22 MCF -dont 11 HDR- et 2 ATER),  14 personnels BIATSS et 10 doctorants.

Contacts

lubem@univ-brest.fr                                                                                                                                

Secrétariat Plouzané :

Marielle.LeGuen@univ-brest.fr
Tél. : 02 90 91 51 11

Secrétariat Quimper :

lisa.martin@univ-brest.fr
Tél. : 02 98 90 85 58

 

Le LUBEM

en quelques photos...