Laboratoire Universitaire de Biodiversité et d'Ecologie Microbienne

Laboratoire Universitaire
de Biodiversité
et d'Ecologie Microbienne

Présentation du LUBEM

 

Bienvenue sur le site du LUBEM (UR 3882).

Le LUBEM est le Laboratoire Universitaire de Biodiversité et d’Ecologie Microbienne, Unité de Recherche n°3882.

Le LUBEM est un laboratoire de recherche de l’Université de Bretagne Occidentale spécialisé dans l’étude de la biodiversité et de l’écologie des micro-organismes, et ce principalement en agro-alimentaire et en environnement.
Le LUBEM est une EA reconnue par le MESRI au titre du contrat quinquennal 2016-2021, et sa stratégie et son projet à 5 ans ont été jugés Excellents par l'HCERES en 2016.
Il regroupe les activités de recherche en microbiologie de l’UBO (Université de Brest) rattachées à l’Ecole Doctorale EGAAL (ED 600) « Écologie, Géosciences, Agronomie, ALimentation ».
Le laboratoire est associé à l'ADRIA Développement (Quimper) au sein de l’UMT ALTER'iX ACTIA 18.03 portant sur la prévision et modulation de l’altération des aliments due à la présence de bactéries sporulées et moisissures (2019-2023) et est membre de l'Institut Brestois Santé- Agro- Matière (IBSAM).

Le LUBEM est une composante de l'Institut Carnot AgriFood Transition.

Le LUBEM regroupe des membres de différentes composantes d’enseignement :

Le schéma directeur du LUBEM est le suivant :

 

Le LUBEM a 2 axes applicatifs :

  • Ecosystèmes à composantes fongiques (moisissures et levures).
  • Risques associés aux bactéries sporulées.

Les travaux de ses équipes sont structurés selon 4 domaines d’études communs aux 2 axes applicatifs:

  • Ecologie : identification, quantification et caractérisation des micro-organismes associés aux écosystèmes d’intérêt (agriculture, aliment et environnement marin), évolution des communautés microbiennes lors des variations de leur environnement.
  • Physiologie : comportement des micro-organismes sous l’effet de de facteurs biotiques et abiotiques (dont approche de microbiologie prévisionnelle).
  • Métabolisme : rôle des micro-organismes dans leurs écosystèmes, étude de métabolites à impact négatif ou positif (dont impact toxicologique) et de leurs voies de biosynthèse.
  • Maîtrise : application de méthodes physico-chimiques et biologiques pour le contrôle de micro-organismes indésirables ( d’altération ou pathogènes).

L’étude de la biodiversité des micro-organismes et de leur écologie constituent des thèmes communs aux membres du laboratoire comme son nom l’indique.

Organisation et composition de l’équipe :

Le LUBEM est présent sur 2 sites géographiques (Plouzané et Quimper) et est structuré en 2 équipes  de recherche correspondants aux 2 axes applicatifs décrits ci-dessus.

Directeur du LUBEM - EA3882: Pr. Emmanuel COTON

Groupe 1. ESIAB, Plouzané, Axe "Ecosytèmes fongiques"

Responsable :  Pr Jérôme MOUNIER
Mots clés : Champignons filamenteux, Bactéries, Agro-alimentaire et Environnement

Groupe 2, IUT-ESIAB, Quimper, Axe "Bactéries sporulées"

Responsable : Pr Louis COROLLER
Mots clés : Microbiologie prévisionnelle, dynamique des populations microbiennes, antimicrobiens, Agro-alimentaire

L’effectif au 30 juin 2020 de l’UR3882 est constitué d’enseignants-chercheurs universitaires (5 PR, 20 MCF -dont 12 HDR- et 1 ATER),  13 personnels BIATSS, 2 post-doctorants et 13 doctorants.

Contacts

lubem@univ-brest.fr                                                                                                                                

Secrétariat Plouzané :

Marielle.LeGuen@univ-brest.fr
Tél. : 02 90 91 51 11

Secrétariat Quimper :

Tél. : 02 98 90 85 58

 

Le LUBEM

en quelques photos...